Η θαυμαστή ιστορία της, συνδέεται με την τραγική περίοδο της εικονομαχίας: Στις αρχές του 9ου αιώνα, στην Κωνσταντινούπολη μια ευσεβής γυναίκα η Βικτωρία, είχε στο σπίτι της την εικόνα της Παναγίας της Γλυκοφιλούσας. Φοβούμενη όμως το μένος των εικονομάχων προς τις εικόνες, αλλά και τις τιμωρίες που επέβαλλαν σε όσους χριστιανούς είχαν εικόνες ή τις έκρυβαν στις οικίες τους, αποφάσισε να την κρύψει για να την γλιτώσει από την καταστροφή.
Μην έχοντας τίποτα καλύτερο να κάνει, πήγε σε μια ακροθαλασσιά και με πολύ θέρμη προσευχήθηκε εμπρός στην εικόνα, ζητώντας από την Παναγία να αναλάβει την προστασία της και αφού προσκύνησε για τελευταία φορά την εικόνα την έριξε στη θάλασσα… Και ω του θαύματος, η εικόνα στάθηκε όρθια στην επιφάνεια της θαλάσσης και άρχισε να πλέει!!! Μετά από καιρό η εικόνα της Παναγίας της Γλυκοφιλούσας προσόρμισε στην περιοχή του Αγίου Όρους , εκεί που σήμερα βρίσκετε ο αρσανάς της Ι. Μ. Φιλοθέου.
Ενάμιση αιώνα αργότερα και ενώ η Ι. Μ. Φιλοθέου είχε χτιστεί, η εικόνα εμφανίστηκε και πάλι στη θάλασσα αστράφτοντας! Τότε οι μοναχοί, κατάλαβαν ότι πρόκειται για θαύμα και κάνοντας λιτανεία κατέβηκαν στην παραλία. Εκεί είδαν την εικόνα μέσα στη θάλασσα. Την έβγαλαν στην ακτή και στο σημείο που την ακούμπησαν ανέβλυσε αμέσως αγίασμα! Οι μοναχοί δεόμενοι ευχαρίστησαν την Παναγία για την ευλογία που τους έδωσε και έβαλαν την εικόνα της στο καθολικό της Μονής, όπου βρίσκεται έως σήμερα.